Использование Анавара уменьшит естественную ось гипофиза, необходимую для поддержания выработки тестостерона. У мужчин, которые используют Анавар, наблюдается снижение уровня ЛГ, ФСГ, ГСПГ, а также общего и свободного тестостерона. Чаще всего Анавар комбинируют с тестостероном у мужчин с хронической мышечной атрофией или ВИЧ-инфекцией.
Было показано, что использование Анавара снижает уровень глобулина, связывающего половые гормоны (ГСПГ). Снижение уровня ГСПГ увеличивает количество свободного тестостерона (активного) в организме.